Par principe, le SINP considère que toutes les informations d’origine de la donnée brute sont conservées à chaque étape de circulation depuis son intégration dans la base de données de l’observateur ou du producteur, jusqu’à sa transmission à l’INPN. Le format national pour la transmission des données de faune et de flore est appelé "standard d’occurrences de taxon". Il possède 140 attributs, obligatoires ou facultatifs.

Par souci de facilité d’utilisation, un format régional simplifié issu de ce standard comprenant 29 attributs est proposé pour la transmission des données de faune et de flore. Il permet à tout producteur de données (collectivités, bureau d’études, associations, scientifiques, particuliers) de transmettre ses données de manière standardisée, donc communicable et échangeable. Les données sont intégrées progressivement sur la plateforme des données naturalistes régionales.

Les données sensibles sont définies par le protocole du SINP, en référence à l’article L.124-4 du code de l’environnement, comme des données particulières qui ne doivent pas être largement diffusées pour éviter de porter atteintes aux éléments qu’elles concernent. En Pays de la Loire, cette liste a été établie pour la faune et la flore. Elle a été validée par le Conseil scientifique du patrimoine naturel (CSRPN) le 3 octobre 2019 et par le Muséum national d’histoire naturelle le 11 février 2020. Elle compte 497 espèces.